在濱海抗日根據地最困難的時刻，山東黨政軍領導機關由魯中進入濱海地區。1941年1月，八路軍第一一五師教導第二旅第六團、第四團先后從魯南進入濱海南部的郯碼、蒼馬和贛榆地區。3月上旬，中共山東分局、山東省戰工會、八路軍第一一五師師部等領導機關，從魯中轉移到濱海地區。從這時起直到抗日戰爭勝利，山東黨政軍領導機關絕大部分時間駐在濱海地區。

　　   山東黨政軍領導機關進駐濱海地區后，為震懾日偽，迅速打開局面，首先發起青口戰役。3月19日，第一一五師教導第二旅和山東縱隊以突襲戰術，向贛榆縣青口沿海一帶日偽據點發起攻擊。青口戰役，共攻克海頭、興莊等日偽據點，解放了從柘汪到下口之間南北40多里長的海岸線和大片土地，擴大了濱海抗日根據地，改善了濱海與華中和膠東的聯系，緩解了部隊供給方面的困難。

　　   青口戰役后，第一一五師教導第二旅在第五十七軍補充團和贛榆縣地方武裝的配合下，乘勝向贛榆縣南部和東海縣進軍。同時，第一一五師和山東省各救會及第五地委分別派出工作團，先后到贛榆等地開展工作，使濱海南部贛榆、東海的對敵斗爭等出現了新的局面。

　　    與此同時，為反擊國民黨頑固派和“萬仙會”的進攻，4月8日至5月16日，濱海地區發起抗日討逆反投降戰役。濱海地區的頑固派許樹聲、尹鼎武、李延修、朱信齋以及“萬仙會”被趕回莒日公路以北。討逆戰役取得重大勝利。為徹底鞏固我路南根據地，八路軍115師先后集中了教導二旅、教導五旅、濱海軍分區獨立團、111師及抗大一分校萬余人，于1942年8月至12月發動了甲子山三次反頑戰役，殲敵3500余人，孫煥彩帶領數百殘兵逃往路北，我軍控制了甲子山區。從根本上扭轉了濱海區的形勢，對開辟路北具有重大意義。

　　1943年4月，根據中共山東分局關于“各區黨委、地委實行一元化領導，統一軍事指揮”的指示，中共濱海地委改為濱海區黨委，建立與區黨委同級的行政機構濱海公署。教導二旅番號撤銷，濱海軍分區改為濱海軍區。至此，濱海區實行黨政一元化領導，成為全省五大戰略區之一。