抗日戰爭時期，遼闊的清河平原，既是威脅敵人交通要道膠濟鐵路和戰略要地濟南的前沿陣地，又是連接魯中、膠東和冀魯邊三區的交通聯絡樞紐。全面抗戰爆發后，中共山東省委和魯東工委在這一地區，連續組織發動了多次抗日武裝起義，相繼建立了山東人民抗日救國軍第5軍、魯東游擊隊第8支隊等由黨直接領導的抗日隊伍，在鄒平、長山、桓臺、臨淄、章丘、淄川、博山、壽光、濰縣和昌邑等地建立了抗日游擊區。

　　1938年5月，中共清河特委成立，立即著手恢復、建立和充實中共地方組織，創建清河區抗日根據地。至12月，清河部隊奉命改編為八路軍山東縱隊第三支隊，成為清河地區抗日斗爭的主力部隊。

　　1939年春，三支隊粉碎了日軍對小清河南部地區的圍攻，堅持了該地抗日斗爭。10月，遵照八路軍第一縱隊司令員徐向前等就清河區抗日游擊戰爭的發展作出的重要指示，清河主力部隊挺進以壽光清水泊為重點的清河平原地區，并繼續向小清河以北地區發展，控制至魯北沿海、黃河入海口的廣闊地區。翌年10月，中共清河區黨委成立，隨之成立了清河區行政主任公署、八路軍清河軍區，各級抗日民主政權和抗日群眾團體一并成立。至此，清河區經過艱難曲折的發展歷程，具有較穩固的根據地和較系統完整的組織機構的重要戰略區。

　　1941年至1943年，清河區軍民粉碎了日偽軍發動的多次“掃蕩”和“蠶食”，根據地軍民與日寇進行了長期的斗爭。1944年初，清河區與冀魯邊區奉命合并為渤海區。至此，清河區完成了她的光榮歷史使命，原屬清河區的各級黨組織在渤海區黨委的領導下開始了新的戰斗歷程。